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2、水分问题
种植出芽需要90%以上的土壤湿度，如果底水浇得不足，或者由于没有覆地膜、温度过高等原因，导致水分大量蒸发，而产生土壤缺水的状态，就会影响种子的发芽。
使用苗床育苗的时候，需要浇足底水，苗床西周垒砌高垄，放水搞过垄面10公分，等水分完全下渗完毕，才可以播撒种子。巴萨种植后，在种植上面覆盖一层营养土，浇水淋湿盖上一层地膜。
使用穴盘育苗时，需要把基质用水湿润到用水可抓握成团的状态，然后装盘播种，播种完覆上一层基质，浇一遍透水，然后用地膜覆盖。
种子播种后用地膜覆盖，是关键措施，不仅可以提高土壤的温度，重要的是保证土壤的湿度，防止因气温过高导致水分蒸发量过大，造成土壤缺水。
3、埋土过深
种子发芽需要消耗氧气，氧气不足也会影响种子发芽。缺少氧气会让种子在发芽的时候进行无氧呼吸，导致酒精的积累从而使种子、失去发芽能力。
往往种子埋土过深会造成整枝缺少氧气，发不出芽。苗床育苗撒播完种子之后，在其上覆盖一层0.5-1公分的营养土。埋土太浅会因为表层土易失水造成种子缺水不萌发，还会造成种子萌发出来出现“戴帽苗”，子叶无法正常展出;埋土太深会造成下部土壤空气氧气缺乏，容易捂种，还会造成距离太远出芽困难等情况。因此种子上部覆盖营养土的厚度也会影响种子的出芽。
1 大棚栽培技术要点
1.1 育苗时间
秋季延迟栽培，一般播种时期为7月上中旬，不宜超过7月20日；8月下旬9月上旬定植，苗龄30天左右。
1.2 育苗床的选择和处理
育苗床宜选用肥沃疏松透气的土壤，且3～5年内未种植过其他茄科植物，防止病虫害。栽植前应深耕土壤，整平，用50%多菌灵可湿性800倍液对土壤进行喷施。施足基肥，每667 ㎡施有机肥5 000 kg、过磷酸钙30～50 kg、硫酸钾25～50 kg，保证土壤养分在较长时间内满足辣椒植株生长的需要。可通过沟施或穴施提高肥效，防止分散性铺施导致基肥烧苗，从而降低成活率。施肥深度要合理，以土层下10～15 cm为宜，在距离基肥一定距离处布置定植穴。根据定植方法选择盖膜方式，一般有先定植后盖膜和先盖膜后定植2种。盖膜前，应保证畦土表面平整，薄膜平展后拉紧，紧贴于苗床，两侧用土压实。定植前1周盖膜，可提高使用质量。铺膜前应保证有5天的日光晾晒和良好的通风环境，以降低苗床土壤湿度，避免水分过多抑制幼苗萌发新根，导致苗株大量。
番茄黄化曲叶病毒病
是由花叶病毒和马铃薯Y病毒复合侵染引起的西红柿病毒病。该病在2009年山东寿光以及多个主要西红柿种植区发生，以越夏茬和秋延迟茬口受害严重，植株主要表现生长点附近叶片黄化、扭曲生长，叶片变平、硬化和黄化症状，出现菜农常说的“平顶生长”状态，所以又称为“黄化曲叶病毒病”。植株受害后，生长速度减缓甚至生长停滞，植株在田间表现严重矮化，植株开花结果异常，或坐果后果实生长速度慢，发病速度相对较快，幼苗定植后至开花前和开花后至三穗果后是其主要发病时期。烟粉虱是该病的主要传播媒介，虫体获毒后可终身带毒，成虫一般附着在叶背取食和传播病害。人为操作造成的伤口，可以成为其传播途径。